Prvotnou príčinou análnej fistuly je zápal uzlín, nachádzajúcich sa medzi časťami svalov konečníka. Zápal vytvorí kanálik, z ktorého vyteká hnis. V oblasti konečníka vytvorí výduť, ktorá je zapálená a bolestivá. Dosť často je sprevádzaná teplotou a preto vyžaduje chirurgický zákrok. Liečenie je zdĺhavé. Aj pri dôslednom chirurgickom ošetrení u 80 % prípadoch dochádza k obnove aj po niekoľkých rokoch. Prejavuje sa to zdurením výdutín s krvavým hlienením, bolesťou a zápalom kože v okolí konečníka. Fistuly konečníka sa zriedka zhoja samé od seba, vyžadujú chirurgický zákrok. Závažnosť chirurgického zákroku závisí od toho, ako vysoko je fistula umiestnená. Liečba povrchových fistúl je jednoduchá. Liečba vysoko umiestnených fistúl je náročná, vyžaduje vysokú odbornosť a zo strany pacienta trpezlivosť a zvýšenú hygienu.